Mus2’de nota yazımını sağlayan araçlar, Mus2 penceresinin sol kenarındaki araç şeridinde bulunur. Genel olarak nota yazım araçlarının kullanımı, ihtiyaç duyulan aracın seçilmesi ve ardından kağıt üzerine tıklanarak uygulanmasından ibarettir.
Dosya işlemleri, görünüm, yerleşim ve akort gibi genel özelliklere erişim, Mus2 penceresinin üstündeki menüden sağlanır. Bu özelliklerden bazılarına, menünün altındaki simge çubuğundan da hızlı bir şekilde ulaşabilirsiniz.
Mus2’nin Mac sürümünde, menü pencerenin dışında, ekranın en üstünde bulunur. Bu fark dışında programın Windows ve Mac sürümlerinin kullanımı aynıdır.